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【税理士執筆】税務調査で差がつく「決算の質」―経理担当者が会社を守るための実務ポイント

公開日2026/03/12 更新日2026/03/11 ブックマーク数

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【税理士執筆】税務調査で差がつく「決算の質」―経理担当者が会社を守るための実務ポイント

「決算は、1年間の数字を正しく集計して申告書を作れば終わり」

もしそう考えているとしたら、税務調査という観点では少し注意が必要かもしれません。

私は税理士として多くの決算に関与し、税務調査にも立ち会ってきました。
その中で感じるのは、調査官が深く踏み込む会社と、比較的短時間で終わる会社には一定の傾向があるということです。

その違いを分ける大きな要素の一つが、「決算の質」です。

決算の質とは、単に数字が合っているかどうかではなく、

・処理の根拠が説明できるか
・判断基準が整理されているか
・証憑が適切に管理されているか

といった、調査官の視点を意識した準備の積み重ねによって形成されるものです。

本稿では、税理士として数多くの税務調査に関わってきた実務経験をもとに、税務署対策という観点から、経理担当者が押さえておきたい「決算の急所」を具体的に解説します。

[ 目次 ]

石黒健太様 — 執筆者

石黒健太税理士事務所代表
石黒健太

京都府を中心に、クラウド会計、経理DXを強みとし、効率的な税務・会計サポートを提供しています。
また職員が働きやすい環境を重視し、フレックスタイム制（コアタイムなし）をはじめとした柔軟な働き方を推進しています。
他にも税理士業界の課題である繁忙期の残業時間削減に取り組むなど「お客様と職員の共に成長できる事務所づくり」を理念に、業界の新たな可能性を追求しています。

なぜ「同じ決算」でも企業によって差が生まれるのか

税務署は「調査前」に会社の管理レベルを見ている

税務調査は、突然始まるように見えて、実際には事前の情報分析をもとに進められています。
提出された申告書や添付資料から、ある程度の管理レベルやリスクの有無が推測されていると考えられます。

特に確認されやすいポイントとして、次のようなものがあります。

・勘定科目内訳明細書の具体性

たとえば「支払手数料」の内訳が「手数料一式」とだけ記載されているのか、あるいは「システム利用料」「コンサルティング費用」など具体的に分けられているのか。
この違いは、経理が中身をどこまで把握しているかを判断する材料の一つになります。

・専門的な税務処理に関する書類の精度

試験研究費税額控除や賃上げ促進税制、特別償却などは適用要件が複雑です。
これらの届出書や計算根拠が整理されている場合、税務対応に対する意識の高さが伝わりやすくなります。

こうした資料の積み重ねが、調査時の心証に一定の影響を与える可能性があります。

「同業種比較」という視点への備え

税務署は、過去の申告データや統計情報をもとに、業種ごとの平均値や傾向を把握しています。

たとえば、「原価率」「外注費の割合」「交際費の水準」などについて、同業他社と比較した際に大きな差がある場合、その理由を確認されることがあります。

このとき重要なのは、数字の大小そのものよりも、「なぜその差が生じているのか」を説明できる状態にしておくことです。

例としては、

・特殊な仕入れが発生した年度である
・外注比率を意図的に高めた経営判断がある
・大口案件の影響で売上構成が変化した

といった背景を整理しておくことで、調査時の対応が格段にしやすくなります。

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